MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli E24377A plasmid pETEC_73

Total Repeats: 1472

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009788	TCG	3	9	39	47	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009788	CACTT	2	10	128	137	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_009788	GAC	2	6	148	153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009788	GGC	2	6	197	202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009788	CG	3	6	222	227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009788	CCAGCG	2	12	238	249	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009788	GGT	2	6	263	268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009788	TCT	2	6	276	281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009788	CGA	2	6	441	446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009788	AAT	2	6	491	496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009788	CCG	2	6	517	522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_009788	TGC	2	6	554	559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009788	GCG	2	6	576	581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009788	TCC	2	6	741	746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009788	CAG	2	6	755	760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009788	GCTT	2	8	800	807	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009788	GGT	2	6	812	817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009788	ATC	2	6	846	851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009788	CG	3	6	884	889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009788	CT	3	6	898	903	0 %	50 %	0 %	50 %	157149467
21	NC_009788	GGGCG	2	10	1165	1174	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009788	TCC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149468
23	NC_009788	CGG	2	6	1236	1241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149468
24	NC_009788	T	6	6	1302	1307	0 %	100 %	0 %	0 %	157149468
25	NC_009788	CTG	2	6	1338	1343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149468
26	NC_009788	CTG	2	6	1368	1373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149468
27	NC_009788	GC	3	6	1493	1498	0 %	0 %	50 %	50 %	157149468
28	NC_009788	CAC	2	6	1545	1550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149468
29	NC_009788	CGA	2	6	1685	1690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149468
30	NC_009788	TTG	2	6	1699	1704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157149468
31	NC_009788	CCT	2	6	1727	1732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009788	CTC	2	6	1803	1808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009788	T	6	6	1907	1912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009788	GGC	2	6	2029	2034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009788	AGG	2	6	2035	2040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009788	CTG	2	6	2046	2051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009788	CA	3	6	2073	2078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009788	GCG	2	6	2120	2125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009788	CGG	2	6	2203	2208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009788	AGC	2	6	2226	2231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009788	GAC	2	6	2252	2257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009788	GCC	2	6	2263	2268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_009788	GCCGG	2	10	2383	2392	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009788	CG	3	6	2451	2456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009788	GGC	2	6	2465	2470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_009788	CTG	2	6	2501	2506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149478
47	NC_009788	CCG	2	6	2525	2530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149478
48	NC_009788	CTG	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149478
49	NC_009788	TCA	2	6	2570	2575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149478
50	NC_009788	GTG	2	6	2588	2593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149478
51	NC_009788	ACG	2	6	2614	2619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149478
52	NC_009788	TTC	2	6	2733	2738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149470
53	NC_009788	CTGC	2	8	2803	2810	0 %	25 %	25 %	50 %	157149470
54	NC_009788	CCG	2	6	2837	2842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149470
55	NC_009788	GC	3	6	2863	2868	0 %	0 %	50 %	50 %	157149470
56	NC_009788	TTC	2	6	2871	2876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149470
57	NC_009788	AAC	2	6	2889	2894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149470
58	NC_009788	CAC	2	6	3021	3026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149470
59	NC_009788	ACAGT	2	10	3088	3097	40 %	20 %	20 %	20 %	157149470
60	NC_009788	GGC	2	6	3122	3127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009788	GCC	2	6	3131	3136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_009788	CCGT	2	8	3137	3144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009788	ATG	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149453
64	NC_009788	ACGGT	2	10	3326	3335	20 %	20 %	40 %	20 %	157149453
65	NC_009788	CAT	2	6	3382	3387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149453
66	NC_009788	CAT	2	6	3445	3450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149453
67	NC_009788	T	7	7	3450	3456	0 %	100 %	0 %	0 %	157149453
68	NC_009788	GC	3	6	3462	3467	0 %	0 %	50 %	50 %	157149453
69	NC_009788	A	6	6	3517	3522	100 %	0 %	0 %	0 %	157149453
70	NC_009788	ATG	2	6	3572	3577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149453
71	NC_009788	TCC	2	6	3581	3586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_009788	GTT	2	6	3587	3592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009788	GTGCC	2	10	3616	3625	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009788	ACGA	2	8	3734	3741	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009788	AGG	2	6	3765	3770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009788	GCG	2	6	3786	3791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009788	GGCAC	2	10	3832	3841	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_009788	ACG	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009788	CGG	2	6	3918	3923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009788	TCA	2	6	3987	3992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149449
81	NC_009788	TGC	2	6	4022	4027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149449
82	NC_009788	ACC	2	6	4051	4056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149449
83	NC_009788	GCG	2	6	4083	4088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149449
84	NC_009788	GCA	2	6	4109	4114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149449
85	NC_009788	CGA	2	6	4179	4184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149449
86	NC_009788	CAC	2	6	4218	4223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149449
87	NC_009788	CAG	2	6	4252	4257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149449
88	NC_009788	GCG	2	6	4290	4295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149449
89	NC_009788	GGT	3	9	4323	4331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157149449
90	NC_009788	GCC	2	6	4336	4341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149449
91	NC_009788	CGC	2	6	4348	4353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149449
92	NC_009788	CCG	2	6	4400	4405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149449
93	NC_009788	TCT	2	6	4426	4431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157149449
94	NC_009788	GCCA	2	8	4432	4439	25 %	0 %	25 %	50 %	157149449
95	NC_009788	ACTG	2	8	4502	4509	25 %	25 %	25 %	25 %	157149449
96	NC_009788	GCG	2	6	4568	4573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149449
97	NC_009788	CGC	2	6	4580	4585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149449
98	NC_009788	CAG	3	9	4707	4715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149449
99	NC_009788	CGC	2	6	4781	4786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_009788	GGC	2	6	4792	4797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009788	GT	3	6	4819	4824	0 %	50 %	50 %	0 %	157149445
102	NC_009788	CAG	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149445
103	NC_009788	CGG	2	6	4866	4871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149445
104	NC_009788	GGC	2	6	4907	4912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149445
105	NC_009788	CAG	2	6	4961	4966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149445
106	NC_009788	CAG	2	6	4969	4974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149445
107	NC_009788	TGA	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149445
108	NC_009788	GAA	2	6	5031	5036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157149445
109	NC_009788	TCC	2	6	5070	5075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157149445
110	NC_009788	GC	3	6	5078	5083	0 %	0 %	50 %	50 %	157149445
111	NC_009788	AGG	2	6	5305	5310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157149446
112	NC_009788	GCT	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149446
113	NC_009788	TCAT	2	8	5389	5396	25 %	50 %	0 %	25 %	157149446
114	NC_009788	GC	3	6	5443	5448	0 %	0 %	50 %	50 %	157149446
115	NC_009788	TCA	2	6	5500	5505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149435
116	NC_009788	CTG	2	6	5517	5522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149435
117	NC_009788	CGG	2	6	5537	5542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149435
118	NC_009788	TGC	2	6	5551	5556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149435
119	NC_009788	AGC	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157149435
120	NC_009788	GGC	2	6	5616	5621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149435
121	NC_009788	CTGC	2	8	5638	5645	0 %	25 %	25 %	50 %	157149435
122	NC_009788	GT	3	6	5673	5678	0 %	50 %	50 %	0 %	157149435
123	NC_009788	TGA	2	6	5728	5733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157149435
124	NC_009788	CCAGC	2	10	5751	5760	20 %	0 %	20 %	60 %	157149435
125	NC_009788	CAA	2	6	5882	5887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157149435
126	NC_009788	GGC	2	6	5910	5915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149435
127	NC_009788	T	6	6	5967	5972	0 %	100 %	0 %	0 %	157149435
128	NC_009788	CCA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149435
129	NC_009788	AAC	2	6	6159	6164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009788	CGT	2	6	6281	6286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149487
131	NC_009788	TCA	2	6	6332	6337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149487
132	NC_009788	CCCGT	2	10	6396	6405	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_009788	CCG	2	6	6408	6413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_009788	GCCGC	2	10	6446	6455	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
135	NC_009788	GCCC	2	8	6520	6527	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_009788	TCA	3	9	6603	6611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149483
137	NC_009788	C	6	6	6637	6642	0 %	0 %	0 %	100 %	157149483
138	NC_009788	GCCA	2	8	6679	6686	25 %	0 %	25 %	50 %	157149483
139	NC_009788	CGG	2	6	6738	6743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157149483
140	NC_009788	TGC	2	6	6749	6754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149483
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277	NC_009788	CGA	2	6	13307	13312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_009788	TCA	2	6	13368	13373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157149443
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280	NC_009788	CGC	2	6	13564	13569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149443
281	NC_009788	CCA	2	6	13578	13583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157149443
282	NC_009788	CGC	2	6	13660	13665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157149443
283	NC_009788	AAT	2	6	13685	13690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157149443
284	NC_009788	CGG	2	6	13887	13892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_009788	TGC	2	6	13936	13941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149473
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329	NC_009788	ATA	2	6	16123	16128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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388	NC_009788	AAC	2	6	18880	18885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
389	NC_009788	A	7	7	18901	18907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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391	NC_009788	A	6	6	19065	19070	100 %	0 %	0 %	0 %	157149437
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394	NC_009788	A	6	6	19163	19168	100 %	0 %	0 %	0 %	157149441
395	NC_009788	GC	3	6	19249	19254	0 %	0 %	50 %	50 %	157149441
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399	NC_009788	GC	3	6	19297	19302	0 %	0 %	50 %	50 %	157149441
400	NC_009788	GCCG	2	8	19337	19344	0 %	0 %	50 %	50 %	157149441
401	NC_009788	CTG	2	6	19361	19366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157149441
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